Detection of the PMP22 gene duplication in peripheral neuropathy patients: a study in Mexican population
*Correspondencia: Dr. Jonathan Javier Magaña. Laboratorio de Medicina Genómica, CENIAQ. Departamento de Genética. Instituto Nacional de Rehabilitación. Avda. México-Xochimilco, 289. Col. Arenal de Guadalupe. CP 14389. México DF, México.
E-mail: jmagana@inr.gob.mx
Introduction: Charcot-Marie-Tooth disease (CMT) is a neuropathy that affects sensory and motor nerves. The most common CMT subtype is CMT1A due to a PMP22 duplication of a 1.5 Mb fragment on the 17p11.2-p12. The development of a specific molecular technique that detects the PMP22 duplication is necessary for the diagnosis of CMT1A.
Aim: To establish a routinary test for detection of the PMP22 gene duplication in Mexican population and to estimate the CMT1A frequency in patients clinically diagnosed as CMT.
Patients and methods: A cohort of 157 individuals clinically diagnosed as CMT were analyzed. The detection of the PMP22 gene duplication was performed using the comparative 2-ΔΔCT qPCR method.
Results: The comparative 2-ΔΔCT method was sensitive and reliable for the detection of the PMP22 duplication. In order to validate the testing, data was compared with FISH results. Duplication of PMP22 was detected in 79 patients (50.3%). Although CMT1A frequency is different among populations, in Mexican patients it was similar with other populations such as United States, Australia, Finland, Sweden and Spain.
Conclusions: The qPCR technique is an accurate and inexpensive method for the diagnosis of CMT1A. This method can be routinely used in Mexico where CMT1A represents ≍ 50% of CMT cases. Molecular diagnosis of CMT1A is essential for the genetic counseling and treatment of patients.
Objetivos Establecer un método de uso rutinario para detectar la duplicación de PMP22 en la población mexicana y estimar su frecuencia en pacientes con características clínicas para la CMT.
Pacientes y métodos Se analizaron 157 pacientes mexicanos no relacionados entre sí, diagnosticados de CMT por valoración clínica. La determinación de la duplicación de PMP22 se realizó a través de reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real mediante el método comparativo 2–ΔΔCT.
Resultados El método 2–ΔΔCT para detectar la duplicación del gen PMP22 mostró ser sensible y fiable. Los resultados fueron consistentes con los obtenidos mediante la técnica de hibridación in situ fluorescente. Se detectó la duplicación de PMP22 en 79 pacientes (50,3%), con un comportamiento similar a lo comunicado en Estados Unidos, Australia, Finlandia, Suecia y España. Sin embargo, se observó que existen diferencias con otras poblaciones.
Conclusiones La técnica de reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa se implementó como un diagnóstico molecular de CMT1A eficaz y de bajo coste, por lo que puede utilizarse rutinariamente en México. Esto es esencial para el asesoramiento genético y el tratamiento oportuno de los pacientes con CMT. La frecuencia de la duplicación del gen PMP22 varía entre regiones geográficas, por lo que es importante estimarla en diferentes poblaciones.